بررسی و شناسایی نیازهای پژوهشی کشور در حوزه علوم باغبانی
انجام طرحهای پژوهشی بنیادی، کاربردی و توسعه ای به منظور استفاده بهینه از منابع باغبانی کشور با استفاده از روش های مختلف فناوری زیستی
فراهم آوردن امکانات لازم و متناسب با فعالیت های پژوهشی مربوط به باغبانی کشور
انجام تحقیقات لازم برای رفع نیازهای بخش باغبانی کشور
توسعه تحقیقات برای استفاده از روش های نوین باغبانی و کاربرد فناوری های نوین
حفظ ذخایر ژنتیکی باغبانی جهت بهره برداری در برنامه های به نژادی
انجام تحقیقات با هدف دستیابی به ارقام و پایه های اصلاح شده گیاهان باغبانی و معرفی آنها
انجام تحقیقات لازم به منظور تعیین نیازهای ارقام و پایه ها در مناطق مختلف کشور
بررسی مسائل و مشکلات پس از برداشت محصولات باغبانی
تهیه، تامین و نگهداری هسته های اولیه سالم نهال و بذر ارقام ، پایه ها و اندام های تکثیری و برای واگذاری به بخش خصوصی
پیش تکثیر نهال و بذر پایه ها و ارقام برای تامین نیاز باغ های مادری با همکاری مراکز تحقیقاتی و بخش خصوصی
انتشار و ثبت گزارش ها و مقالات علمی و اختراعات حاصل از طرحهای تحقیقاتی در سطح ملی و بین المللی
تهیه برنامه های کوتاه مدت، میان مدت، بلند مدت موسسه و تهیه برنامه و بودجه سالیانه موسسه و پژوهشکده ها و مراکز تحقیقاتی تابعه برای ارائه و تصویب در هیات امناء
نظارت بر اجرای برنامه های تحقیقاتی مربوط به پژوهشکده ها و مراکز تحقیقاتی تابعه و ارزشیابی پروژه های تحقیقاتی
تهیه و ارائه دستورالعمل ها و آئین نامه های لازم برای تصویب در هیات امناء
همکاری با دانشگاه ها ، مراکز آموزش عالی و موسسات تحقیقاتی داخل و خارج برای انجام تحقیقات مشترک و تربیت نیروی انسانی مورد نیاز بخش باغبانی کشور
ترویج و انتقال یافته های تحقیقاتی
مشارکت در بررسی های اقتصادی و بازاریابی محصولات باغبانی
همکاری در ایجاد بستر مناسب جهت تشکیل شرکت های دانش بنیان طبق ضوابط و مقررات
ارتباط مستمر و مداوم با کانون های تولید و انجمن های علمی
کمک به تجاری سازی یافته های حاصل از فعالیت های تحقیقاتی موسسه و درآمدزایی
مشارکت در سمینارها و کنفرانسهای ملی و بین المللی، نمایشگاه ها، بازدیدهای علمی و دوره های آموزشی داخل و خارج کشور